Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL19

Ncoa6, Nuclear receptor coactivator 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,067 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa6Q9JL19 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ncoa6Q9JL19 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ncoa6Q9JL19 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ncoa6Q9JL19 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ncoa6Q9JL19 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ncoa6Q9JL19 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ncoa6Q9JL19 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ncoa6Q9JL19 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ncoa6Q9JL19 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ncoa6Q9JL19 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ncoa6Q9JL19 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ncoa6Q9JL19 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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