Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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