Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms