Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms