Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ap3m1Q9JKC8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ap3m1Q9JKC8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms