Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms