Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS9

Igdcc4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igdcc4Q9EQS9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms