Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms