Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms