Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms