Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7H3

RtcA, RNA 3'-terminal phosphate cyclase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcAQ9D7H3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcAQ9D7H3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcAQ9D7H3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcAQ9D7H3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcAQ9D7H3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcAQ9D7H3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcAQ9D7H3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcAQ9D7H3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcAQ9D7H3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcAQ9D7H3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RtcAQ9D7H3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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