Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms