Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms