Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms