Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2lQ9D478 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Odf2lQ9D478 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Odf2lQ9D478 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Odf2lQ9D478 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2lQ9D478 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2lQ9D478 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2lQ9D478 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2lQ9D478 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2lQ9D478 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2lQ9D478 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2lQ9D478 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2lQ9D478 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2lQ9D478 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2lQ9D478 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2lQ9D478 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2lQ9D478 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2lQ9D478 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms