Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Tmed11Q9D2R4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tmed11Q9D2R4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tmed11Q9D2R4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tmed11Q9D2R4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tmed11Q9D2R4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed11Q9D2R4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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