Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Batf3Q9D275 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Batf3Q9D275 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms