Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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