Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx47Q9CWX9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddx47Q9CWX9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddx47Q9CWX9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddx47Q9CWX9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Ddx47Q9CWX9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Ddx47Q9CWX9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ddx47Q9CWX9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ddx47Q9CWX9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ddx47Q9CWX9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ddx47Q9CWX9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx47Q9CWX9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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