Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Malsu1Q9CWV0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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