Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed6Q9CQG0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms