Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Commd4Q9CQ02 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Commd4Q9CQ02 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Commd4Q9CQ02 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Commd4Q9CQ02 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Commd4Q9CQ02 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Commd4Q9CQ02 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Commd4Q9CQ02 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Commd4Q9CQ02 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Commd4Q9CQ02 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Commd4Q9CQ02 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Commd4Q9CQ02 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Commd4Q9CQ02 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Commd4Q9CQ02 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Commd4Q9CQ02 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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