Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms