Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms