Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms