Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms