Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Vps37bQ8R0J7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Vps37bQ8R0J7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vps37bQ8R0J7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vps37bQ8R0J7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vps37bQ8R0J7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vps37bQ8R0J7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vps37bQ8R0J7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Vps37bQ8R0J7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms