Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsl1Q8K305 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms