Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CD60 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CD60 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CD60 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CD60 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CD60 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CD60 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CD60 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CD60 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CD60 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CD60 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CD60 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CD60 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CD60 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CD60 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CD60 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CD60 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CD60 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CD60 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CD60 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CD60 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CD60 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CD60 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CD60 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CD60 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CD60 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CD60 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CD60 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CD60 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CD60 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms