Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops7bQ8BV13 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms