Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tspan12Q8BKT6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tspan12Q8BKT6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms