Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4dQ8BGV9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Atg4dQ8BGV9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Atg4dQ8BGV9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Atg4dQ8BGV9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Atg4dQ8BGV9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Atg4dQ8BGV9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Atg4dQ8BGV9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4dQ8BGV9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Atg4dQ8BGV9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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