Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Liat1Q810M6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms