Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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NanogQ80Z64 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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NanogQ80Z64 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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NanogQ80Z64 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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NanogQ80Z64 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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NanogQ80Z64 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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NanogQ80Z64 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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NanogQ80Z64 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NanogQ80Z64 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NanogQ80Z64 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NanogQ80Z64 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NanogQ80Z64 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NanogQ80Z64 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NanogQ80Z64 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NanogQ80Z64 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NanogQ80Z64 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NanogQ80Z64 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NanogQ80Z64 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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