Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raver2Q7TPD6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms