Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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