Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf1cQ6PDZ2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms