Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms