Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms