Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms