Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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