Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms