Protein–RNA interactions for Protein: Q640P7

Tbccd1, TBCC domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbccd1Q640P7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tbccd1Q640P7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tbccd1Q640P7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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