Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Vat1Q62465 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vat1Q62465 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vat1Q62465 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms