Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms