Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms