Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usf1Q61069 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usf1Q61069 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usf1Q61069 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usf1Q61069 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usf1Q61069 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usf1Q61069 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf1Q61069 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms