Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp7Q60973 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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