Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms