Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms